Hoogleraar Fons Verbeek, verbonden aan de informatica- en biologie-instituten van de Universiteit Leiden, heeft de fascinatie om alles wat we niet direct kunnen zien, toch in beeld te brengen. Op SleutelstadFM vertelt hij dat door het omrekenen van 2 dimensionale (2D) beelden naar 3 dimensionale (3D)…

Drie docenten van Geesteswetenschappen ontvingen dit jaar de Senior Kwalificatie Onderwijs (SKO). Universitair docent Bruno Verbeek is een van hen. Wat maakt onderwijs volgens hem goed?

Jaarverslag Nederlandse Unesco Commissie 2016

Wim Willems en Hanneke Verbeek hebben de Die Haghe Prijs 2016 gewonnen met hun boek 'Hier woonden wij. Hoe een stad zijn Joodse verleden herontdekt’. Een spannend boek over de opkomst en teloorgang van de joodse gemeenschap in Scheveningen.

Een computer kan veel meer beelden bekijken, en er van leren, dan een menselijke specialist. Voor medische en biologische toepassingen worden AI-systemen in hoog tempo onmisbaar. Ze moeten nog wel leren uitleggen hoe ze tot hun oordeel komen.

Het Computer Systems, Imagery & Media (CSI) onderzoeksprogramma voert fundamenteel onderzoek uit naar methoden en technieken voor het ontwerp, de implementatie en de applicatie van geavanceerde computersystemen.

This thesis deals with the use of sound in interactions in the context of participatory systems and data sonification. We investigate an interactive environment where participants perceive information of the data through sound elements.

Promotor: Prof.dr. J.N. Kok, Co-promotor: F.J. Verbeek

Software development is a complex process. It is important that software products become stable and maintainable assets.

This thesis focuses on two processes involved in fighting infections: metabolism and immune cell motility and navigation.

In this thesis, we have studied cell images from two types of cells, including pollen grains and the immune cells, neutrophils. These images are captured using a bright field microscope and a confocal microscope.

In the era of big data, extracting insights from complex datasets is a key challenge. This thesis demonstrates the superiority of graph-based methods over traditional clustering (e.g., k-means, DBSCAN) and outlier detection for analyzing high-dimensional and noisy data.

Promotores: T.H.W. Bäck, A. Plaat, Co-promotor: F.J. Verbeek

This thesis is about augmented reality (AR). AR is commonly considered a technology that integrates virtual images into a user’s view of the real world.

Natural history collections provide invaluable sources for researchers with different disciplinary backgrounds, aspiring to study the geographical distribution of flora and fauna across the globe as well as other evolutionary processes.

The deeper understanding of an organism's pathology is important for developing treatments. Over centuries of systematic research, clinical researchers have demonstrated that the more information they acquire about the cellular properties and their organisation in the tissue, the better they can understand…

This thesis introduces a relational interaction model and a practical tool for describing, visualising and generating interactive dialogues.

The function of TLRs in innate immunity has aroused worldwide attention soon after its discovery. Because of the broad functions of TLR2 in innate immunity, the drive for the development of TLR2-targeted vaccines or therapeutic treatments has accelerated in the last decades.

Humans perceive the real world through their sensory organs: vision, taste, hearing, smell, and touch. In terms of information, we consider these different modesalso referred to as different channels of information or modals.

In this thesis we will explore the use of fuzzy systems theory for applications in bioinformatics.

Building a Deep Cross-media Transfer Network to extract visual relations that relieve the problem of insufficient training data for visual tasks.

In this thesis I highlight the applications of Oxford Nanopore Technologies (ONT) sequencing. This technique is a relatively new approach in the sequencing field, where nanopores are embedded in a membrane, DNA molecules are pulled through nanopores and an electrical current serving as the sequencing…

The marine shipping industry is one of the strongest emitters of nitrogen oxides (NOx), a pollutant detrimental to ecology and human health. Over the last 20 years, the pollution produced by power plants, the industry sector, and cars has been decreasing.

This thesis investigates the application of deep learning techniques in image analysis across various domains, focusing on four main themes: feature extraction, classification, segmentation, and integration, demonstrating the transformative potential of these technologies.

Optical projection tomography (OPT) is a tomographic 3D imaging technique used for specimens in the millimetre scale.

We have studied shape with a particular focus on the zebrafish model system. The shape is an essential appearance of the phenotype of a biological specimen and it can be used to read out a current state or response or to study gene expression.

Beeldbewerking heeft met de komst van Deep Learning een revolutie doorgemaakt. Dit heeft, in het bijzonder, opmerkelijke voortgang gegeven in het onderzoeksveld variërend van autonome besturing van voertuigen tot medische diagnostiek.

Fons Verbeek participates in a taskforce on digital atlassing in the rodent brain. This taskforce has developed a common reference framework so that the different atlasses that are being used, are interoperable.

Alles wat we niet direct kunnen zien, toch in beeld brengen. Dat is de fascinatie van Fons Verbeek, de nieuwe hoogleraar Computational Bio-Imaging. Inbreng uit de chemie, optica en vooral computationele wetenschappen aan het maken en verwerken van deze beelden geeft meer inzicht in de wereld van het…

Aan de hand van de karakteristieke aspecten van een beeld kunnen bepaalde computers ons vertellen wat het beeld laat zien. Ze kunnen dit leren op dezelfde manier als jonge kinderen beelden kunnen leren herkennen. Het verder verbeteren van deze technieken opent de weg naar een hele reeks nieuwe toepassingen.…

Dit zijn de mensen die binnen de Universiteit Leiden actief zijn op het gebied van kunstmatige intelligentie.

Aan de hand van de karakteristieke aspecten van een beeld kunnen bepaalde computers ons vertellen wat het beeld laat zien. Ze kunnen dit leren op dezelfde manier als jonge kinderen beelden kunnen leren herkennen. Het verder verbeteren van deze technieken opent de weg naar een hele reeks nieuwe toepassingen.…

Vóór de oorlog maakten Joden deel uit van het alledaagse leven in tal van Nederlandse steden en dorpen. Anders, maar wel gelijk. Door de Shoah lijkt het alsof al die duizenden families die hier woonden, er nooit helemaal bij hoorden. Niets is minder waar. Zij drukten een eigenzinnig stempel op vrijwel…