53 zoekresultaten voor “single-molecule biochemistry” in de Publieke website
-
Single-molecule microscopy in zebrafish embryos
Single-Molecule Microscopy (SMM) techniques constitute a group of powerful imaging tools that enable researchers to study the dynamic behavior of individual molecules.
-
Single-molecule fluorescence in sequence space
The sequence-dependence of biomolecular interactions involving nucleic acids and proteins is essential for numerous processes inside the cell. Insights into the underlying molecular mechanisms have been obtained using various biochemical and biophysical methods on two different levels — bulk and sin…
-
Nucleosome stacking in chromatin fibers probed with single-molecule force- and torque-spectroscopy
In human cells, a meter-long DNA is condensed inside a micrometer-sized cell nucleus. Simultaneously, the genetic code must remain accessible for its replication and transcription to functional proteins.
-
Two-photon multifocal microscopy for in vivo single-molecule and single-particle imaging
In this thesis we investigated the ability of two-photon multifocal microscopy for single-molecule microscopy in live cells and organisms.
-
Analytical chemistry and biochemistry of glycosphingolipids: new developments and insights
Advanced mass spectrometry of glycosphingolipids takes the central stage in this thesis. Investigations focus on characterization of glycosphingolipid metabolism in health and disease with emphasis to the detection and accurate quantitation of known and so far unknown glycosphingolipids and closely…
-
Applications of paramagnetic NMR spectroscopy for protein research
The aim of the research presented in this thesis was to develop new methods forchallenging systems in liquid-state NMR using paramagnetic effects generated by thetwo-armed probe CLaNP-5.
-
Plasmonic enhancement of one-photon- and two-photon-excited single-molecule fluorescence by single gold nanorods
This thesis is a collection of experimental attempts to enhance photoluminescence of fluorescent molecules and quantum dots with single gold nanorods (GNRs) and relevant applications.
-
Plasmonic enhancement of single-molecule fluorescence under one- and two-photon excitation
This thesis aims to improve the detection from ultra-weak single emitter by enhancing their emission properties with plasmonic nanostructures. We exploit the wet-chemically synthesized single crystalline gold nanorods (GNRs) as our basic frameworks in the whole studies, simply because of their unique…
-
Towards a single-molecule FRET study of Frauenfelder's nonexponential rebinding of CO in myoglobin
Early time-resolved experiments by Frauenfelder on the ensemble of the kinetic rebinding of CO to myoglobin molecules resulted in a stretched exponential relaxa-tion due to a very large spread of the reaction rates of individual molecules.
-
Structural changes in single chromatin fibers induced by tension and torsion
Promotor: T. Schmidt, Co-promotor: S. J.T. van Noort
-
Towards Optical Detection of a Single Electron
Single-molecule spectroscopy has become a powerful method for using organic fluorescent molecules in numerous applications.
-
The architects of crenarchaeal chromatin: A biophysical characterization of chromatin proteins from Sulfolobus solfataricus
Promotor: Jaap Brouwer, Co-promotor: Remus Th. Dame
-
Structural biochemistry of the pentraxins
Promotie
-
Kampioen in koolhydraatchemie: Hermen Overkleeft wint prestigieuze prijs
Professor Hermen Overkleeft ontvangt de prestigieuze Roy L. Whistler International Award 2024 van de International Carbohydrate Orgasation. De prijs is een erkenning voor Overkleefts bijdrage aan de koolhydraat- en biochemie.
-
Inhibitor Selectivity: Profiling and Prediction
Less than 1 in 10 drug candidates that enter phase 1 clinical trials actually gets approved for human use.
-
Stable single molecules for quantum optics and all-optical switches
Promotor: Prof.dr. M.A.G.J. Orrit
-
Migraine biochemistry and visual snow
Promotie
-
Michel Orrit ontvangt Spinozaprijs in Koninklijke Schouwburg
Op 12 september heeft Michel Orrit zijn Spinozaprijs in ontvangst genomen uit handen van OCW staatssecretaris Sander Dekker in de Koninklijke Schouwburg in Den Haag. Met de prijs is een premie gemoeid van 2,5 miljoen euro, die vrij is te besteden aan wetenschappelijk onderzoek naar keuze, en het felbegeerde…
-
Single-molecule microscopy in zebrafish embryos
Promotie
-
‘Kijk buiten de eigen vakdisciplines’
Voor goed onderzoek is het nodig om buiten de grenzen van vakdisciplines te kijken, stelt hoogleraar moleculaire en cellulaire biochemie Remus Dame in zijn oratie op 10 mei. Zo zouden processen die plaatsvinden op DNA niet alleen moeten worden onderzocht in een reageerbuis maar ook in levende cellen…
-
Single-molecule fluorescence in sequence space
Promotie
-
Brede media-aandacht voor Spinozaprijs Michel Orrit
Bij een belangrijke onderscheiding als de Spinozaprijs, de 'Nederlandse Nobelprijs', hoort veel aandacht in de media. Een overzicht.
-
Biochemistry in different phases of the migraine attack
Promotie
-
NMR Faciliteit
Met de NMR faciliteit doen we onderzoek naar de synthese van paramagnetische moleculen om kennis te vergaren over de structuur en dynamiek van eiwitten. Deze kennis kan dienen als basis voor een medicijn dat zich hecht aan een eiwit of voor de ontwikkeling van vaccins. Medicijnontwikkeling is één van…
-
How Electrostatic Interactions Drive Nucleosome Binding of RNF168 & PSIP1
The studies presented in the work show the potential of the integrative use of biophysical data in defining the structural basis of protein interactions.
-
Development of kinase inhibitors and activity-based probes
Promotor: H.S. Overkleeft, J. Neefjes, Co-promotor: M. van der Stelt
-
The Role of Linker DNA in Chromatin Fibers
The genetic information of all living organisms is contained in their DNA. Cells modify the degree of DNA compaction by epigenetics, which largely determines what genes are read out and which genes are transcriptionally silent.
-
Nobelprijswinnares was in Leiden: ‘Een wetenschappelijke rockster in ons midden’
Op 28 september bezocht de beroemde scheikundige Carolyn Bertozzi de Universiteit Leiden om te spreken tijdens de LED3 seminar. Precies één week later werd bekend dat zij de Nobelprijs voor Scheikunde zou ontvangen. De Leidse chemici Sebastian Pomplun en Hermen Overkleeft zijn fan: ‘Het is een hele…
-
Activity-Based Proteasome Profiling
Promotor: Prof.dr. H.S. Overkleeft
-
Understanding functional dynamics and conformational stability of beta-glycosidases
Due to their central physiological roles in living organisms, retaining beta-glycosidases have been the subject of tremendous research efforts to examine their structure/function relation using numerous biophysical and biochemical approaches.
-
Systems pharmacology of the endocannabinoid system
In this thesis, a system pharmacology approach, integrating metabolomics, pharmacology and chemical biology, was applied to understand and modulate the endocannabinoid system across different model systems (cells, zebrafish, mice and humans).
-
Allosteric modulation by sodium ions and amilorides of G protein-coupled receptors
Promotor: A.P. IJzerman
-
Allosteric modulation by sodium ions and amilorides of G protein- coupled receptors
Promotor: A.P. IJzerman
-
Leids Instituut voor Onderzoek in de Natuurkunde
Onderzoek aan het Leids Instituut voor Onderzoek in de Natuurkunde (LION) is fundamenteel en nieuwsgierigheids-gedreven. Al onze wetenschappers delen de wens om de kennis van de wereld om ons heen te vermeerderen, in een open, nieuwsgierige sfeer, waarin innovatieve ideeën ontstaan die toepassingen…
- Onderzoeksoutput
-
Assistant Professor in Protein Design
Wiskunde en Natuurwetenschappen, Leids Instituut voor Chemisch Onderzoek (LIC)
-
Biologische origami op moleculair niveau: vouwen met een enkel eiwit
Menselijke cellen beschermen hun eiwitten tegen ontvouwen en samenklonteren. Dat ontdekten biofysicus Alireza Mashaghi en zijn team na zeven jaar diepgaand onderzoek naar de vouwmechanismen van eiwitten. Met een nieuwe, baanbrekende methode slaagde het team erin om een afzonderlijk eiwit te vouwen en…
-
Michel Orrit wint Edison Volta Prize
De European Physical Society heeft de prestigieuze Edison Volta Prize toegekend aan Leids natuurkundige Michel Orrit. De prijs wordt elke twee jaar uitgereikt aan een individu of groep van maximaal 3 wetenschappers ter erkenning van een buitengewone prestatie in natuurkundig onderzoek.
-
Physics Summer School van start
Het Leidse natuurkunde-instituut organiseert van 22 juli tot 1 augustus haar jaarlijkse Summer School: ‘Modern Physics at all Scales’.
-
LION Zomerschool: Modern Physics at all Scales
Het Leidse natuurkunde-instituut organiseert van 16 tot 26 juli haar jaarlijkse summer school ‘Modern Physics at all Scales’.
-
Biofysici ontrafelen als eerste de exacte vouwing van één gen
De manier waarop genen zijn opgevouwen bepaalt hoe vaak ze tot uiting komen in ons lichaam. Leidse biofysici hebben nu als eerste deze structuur molecuul-voor-molecuul ontrafeld. Publicatie op 1 december in Nature’s Scientific Reports.
-
Wordt duurzame biotechnologie werkelijkheid? Samen op zoek naar betere biokatalysatoren
Alles gemaakt van bioproducten: plastic, medicijnen en brandstof. Het lijkt een utopie uit een verre toekomst. Maar voor hoelang nog? Een groep onderzoekers heeft het idee om dit ontwikkelingsproces flink te versnellen. Door machine learning te combineren met labautomatisering, komt deze bio-toekomst…
-
Gratis online cursus leert je alles over imaging
Hoe breng je larven van de zebravis microscopisch in beeld? De nieuwe gratis online cursus ‘Imaging the Vertebrate embryo’ leert je er alles over. Leidse promovendi Salomé Muñoz Sánchez en Radoslaw Gora werkten mee aan de cursus.
-
Moleculen tellen in levende cellen
Biofysicus Rolf Harkes heeft een microscoop ontwikkeld die individuele moleculen kan lokaliseren in levende cellen. Dit verbetert de traceertechnieken voor ziektes als kanker en Parkinson op cellulair niveau. Promotie op 13 januari 2016
-
Het effect van ontstekingsremmende medicijnen op ons lichaam ten aanzien van stress
Promovenda Femke Lokke Groeneweg onderzocht hoe onze cellen en ons lichaam omgaan met stress en wat het effect is van ontstekingsremmende medicijnen. Promotie 6 november 2014.
-
Nieuwe meetmethode brengt moleculaire chips dichterbij
Leidse en Delftse wetenschappers hebben vastgesteld wat elektronentransport via een enkel molecuul zo moeilijk maakt. Ze ontdekten dit dankzij een nieuwe meetmethode. Hun bevinding brengt elektronische chips een stap dichterbij. Ze publiceerden erover in Nature Nanotechnology.
-
Vier grote subsidies voor excellente Leidse onderzoekers in de chemie
NWO Chemische Wetenschappen verdeelt 11,5 miljoen euro onder excellente wetenschappers via de TOP-, ECHO- en ECHO-STIP-subsidies. Hiermee kunnen in totaal 35 onderzoeksprojecten over de gehele breedte van de chemie van start gaan. Vier van die onderzoeksprojecten zijn van de Leidse bètafaculteit.
-
Prijzen en Subsidies 2020
Een overzicht van awards en prijzen die in 2020 zijn toegekend aan onze medewerkers en studenten, maar ook bijzondere benoemingen aan de Universiteit Leiden en andere instellingen.
-
Leidse chemici ontrafelen één van de mysteries van Multiple Sclerose
Leidse chemici hebben een nieuw mechanisme ontdekt dat zou kunnen verklaren hoe Multiple Sclerose zich ontwikkelt tot een ernstigere vorm. Met hun bevindingen dragen ze bij aan het ontrafelen van het mysterieuze verloop van de ziekte. Het onderzoek is gepubliceerd in het tijdschrift Biochemistry.
-
Media en interactie
Media & interactie is waar kunstmatige intelligentie en machine learning samenkomen met filosofie, cognitieve wetenschap en de creatieve kunsten. Voorbeelden van onderzoeksvragen in dit domein zijn: ‘Kan een algoritme naar menselijke maatstaven creatief zijn?', 'Kunnen creatieve processen, zoals het…