Software en hardware
Software-advies
Dit betreft advies over hoe software kan helpen bij het uitvoeren van onderzoek. Dit kan zowel voorafgaand aan het onderzoek als tijdens het onderzoek. Het advies kan bestaan uit het adviseren over het gebruik van een bepaald softwarepakket of het maken van eigen software.
In principe wordt alleen software geadviseerd die door de Universiteit is goedgekeurd en ‘duurzaam’ is (zie Softwaremanagement). Gestreefd wordt naar enige uniformering om het aantal applicaties te beperken. Niet alle bestaande softwarepakketten zijn kosteloos te gebruiken voor onderzoekers. Meer informatie bij researchsupport@hum.leidenuniv.nl.
Softwarepakketten
Softwarepakketten
|
Softwarepakket |
Omschrijving |
|
Amberscript |
AI-gestuurde transcriptiesoftware voor audio/video, met professionele correctiemogelijkheden. |
|
ArcGIS (niet geadviseerd) |
Commerciële GIS-software van Esri; krachtig maar minder aanbevolen vanwege licentiebeperkingen. |
|
ATLAS ti |
Software voor kwalitatieve data-analyse van tekst, audio, video en afbeeldingen; ondersteunt codering, visualisatie en AI-gestuurde transcriptie. |
|
Babybase (via LUCL) |
Tool voor analyse van babygeluiden en taalontwikkeling |
|
BioSemi |
Hardware en software voor EEG-, ECG- en EMG-metingen; gebruikt ActiView voor real-time data-acquisitie en export in BDF-formaat. |
|
Blender |
Open-source 3D-modelleringssoftware voor het creëren van animaties, visualisaties, 3D-prints, games en VFX. Ondersteunt modelleren, sculpting, rigging, rendering en simulaties. |
|
BrainVision Analyser |
EEG/ERP-analysepakket met milliseconde-nauwkeurigheid; biedt geavanceerde preprocessing, visualisatie en MATLAB-integratie. |
|
Cura |
Slicing-software voor 3D-printen, ontwikkeld door Ultimaker. Zet 3D-modellen om in printinstructies (G-code) en biedt uitgebreide instellingen voor printkwaliteit en snelheid. |
|
DataverseNL |
Platform voor het duurzaam opslaan en delen van onderzoeksdata, zoveel mogelijk in Open Access. |
|
Delilah |
Semantische parser van het Nederlands. |
|
E-Prime |
Stimuluspresentatiesoftware voor gedragswetenschappelijk onderzoek; biedt nauwkeurige timing, scripting en hardware-integratie. |
|
Gephi |
Desktopapplicatie voor netwerkvisualisatie en -analyse. Geschikt voor het verkennen van sociale, semantische en biologische netwerken met interactieve grafieken en statistieken. |
|
Gorilla |
Online platform voor het bouwen van gedragswetenschappelijke experimenten; ondersteunt surveys, reactietijdtaken en multiplayer-interfaces. |
|
HTML |
Markup-taal voor het structureren van webpagina’s. |
|
JavaScript |
Programmeertaal voor interactieve elementen en dynamiek op websites. |
|
Loghi |
Voorkeursalternatief voor Transkribus. |
|
LUCRIS |
De Universiteit Leiden registreert haar wetenschappelijke publicaties en activiteiten via LUCRIS. Vanuit LUCRIS wordt de tab Publicaties op de persoonlijke profielpagina's automatisch gevuld. |
|
MySQL/MariaDB/PostgreSQL |
Relationele databasesystemen voor opslag en beheer van gestructureerde data. |
|
Neo4j |
Graph database voor het modelleren van relaties tussen data |
|
Nodegoat |
Webgebaseerde omgeving voor data-opslag en -verwerking, netwerkvisualisatie en analyse in de geesteswetenschappen. |
|
OpenRefine |
Tool voor het opschonen, transformeren en verrijken van ‘rommelige’ datasets. Ideaal voor het standaardiseren van termen, het corrigeren van inconsistenties en het koppelen aan externe bronnen zoals Wikidata. |
|
Overleaf |
Online LaTeX-editor voor wetenschappelijke documenten; ondersteunt samenwerking, versiebeheer en duizenden sjablonen. |
|
Python |
Programmeertaal voor snelle ontwikkeling van webapplicaties. |
|
Django |
Webframework voor gebruik met Python. |
|
QGIS (via LUCDH) Preferred |
Open-source GIS-software voor ruimtelijke data-analyse en kaartvisualisatie. |
|
Qualtrics |
Cloudgebaseerd platform voor surveys en experience management; geschikt voor marktonderzoek, klanttevredenheid en academisch gebruik. |
|
R (via LUCL) |
Programmeertaal voor statistiek en data-analyse |
|
Slurm |
Job scheduler voor high-performance computing clusters |
|
Streamlit |
Framework voor het bouwen van interactieve data-apps in Python |
|
SURF Research Drive |
Cloudopslag in NL voor onderzoeksdata, in het bijzonder voor onderzoeksdata met gevoelige persoonsgegevens. |
|
Tobii |
Eye-tracking hardware/software voor cognitief en taalkundig onderzoek |
|
Transkribus |
Platform voor automatische transcriptie en tekstherkenning van historische documenten. Er wordt gewerkt aan een lokale versie genaamd Loghi. Zodra Loghi gereed en beschikbaar is heeft deze de voorkeur. |
|
Unity (game engine) |
Unity is een krachtige, platformonafhankelijke 3D-engine en een gebruiksvriendelijke ontwikkelomgeving waarmee je eenvoudig 3D-games kunt maken. |
|
Vertaalsoftware |
Verzamelnaam voor tools zoals CAT-tools en machinevertaling; ondersteunt vertaalgeheugen, terminologiebeheer en kwaliteitscontrole. |
|
VPN |
Een extra beveiligde internetverbinding. De Universiteit biedt eduVPN aan, maar ook maatwerkoplossingen i.s.m. het ISSC zijn mogelijk. |
|
VSCode |
Visual Studio. Lichtgewicht en uitbreidbare code-editor van Microsoft. Ondersteunt tientallen programmeertalen, debugging, Git-integratie, extensies en samenwerking via Live Share. |
|
Wordpress |
Open-source CMS voor het bouwen en beheren van websites en blogs. |
|
Yoda |
‘Your data'. Datamanagement platform voor opslag (en publicatie) van onderzoeksdata |
Software-ontwikkeling
Het betreft hier het ontwikkelen van maatwerksoftware, waaronder: het opzetten van online databases, het opzetten van externe websites, scripts voor de ALICE supercomputer en VR applicaties. Er wordt eerst gekeken of er standaardoplossingen beschikbaar zijn voordat maatwerk geleverd wordt. Implementeren van de standaardoplossing gebeurt met projectbudget. Meer informatie bij researchsupport@hum.leidenuniv.nl.
Softwaremanagement
Onder softwaremanagement wordt verstaan: het beoordelen van applicaties op het criterium van duurzaam gebruik, d.w.z. het inschatten van het functioneren van een applicatie op de ‘langere’ termijn. Dat is nodig om wetenschappelijke exposure in stand te houden en investeringen te beschermen. De focus ligt op het beoordelen van de leverancier, het product en de onderliggende software-bouwstenen. Hiervoor heeft PIOn een lijst met beoordelingscriteria aangelegd. Met BIV-classificaties vanuit het Security Office worden de risico's van applicaties ingeschat. Meer informatie bij researchsupport@hum.leidenuniv.nl.
Aanschaf van soft- en hardware
Hardware
De faculteit stelt voor alle medewerkers een standaard laptop of PC ter beschikking die te gebruiken is voor de meeste basistaken. Veel onderzoekers zullen daar prima mee uit de voeten kunnen (evt aangevuld met de apparatuur in de labs. Als je echter voor je onderzoek apparatuur nodig hebt (al dan niet te gebruiken in een van de labs) die daarbuiten valt, wend je dan tot IFZ. De adviseurs kunnen je helpen bij de selectie van IT-componenten of andere apparatuur en de inzet van je projectbudget voor de aanschaf ervan via de kanalen die daarvoor zijn ingericht. Wie geen budget beschikbaar heeft voor apparatuur kan worden geholpen met advies m.b.t. de beschikbare subsidies voor de aanvraag hiervan.
Software
Voor software geldt grotendeels hetzelfde als voor hardware. Als de programmatuur op de laptop of in de labs niet toereikend is kan er worden gekeken naar aanschaf van nieuwe programmatuur. Uit eigen budget of via een subsidie. Aanvullend hierop kan IFZ met je kijken naar het “in house” ontwikkelen van een onderzoeksapplicatie. In gevallen waarin de gewenste functionaliteit niet (gemakkelijk) op de markt te krijgen is kan onze programmeur in nauwe samenwerking met de onderzoeker werken aan het ontwikkelen van specialistische software.