The function of TLRs in innate immunity has aroused worldwide attention soon after its discovery. Because of the broad functions of TLR2 in innate immunity, the drive for the development of TLR2-targeted vaccines or therapeutic treatments has accelerated in the last decades.

In this thesis I highlight the applications of Oxford Nanopore Technologies (ONT) sequencing. This technique is a relatively new approach in the sequencing field, where nanopores are embedded in a membrane, DNA molecules are pulled through nanopores and an electrical current serving as the sequencing…

Bent u zoekende hoe u modelleren een rol kan geven binnen uw biologieonderwijs? Vind u modelleren leuk, wilt u uw kennis delen en halen hoe u modellen kunt koppelen aan voor leerlingen aansprekende contexten? De steunpunten bieden een PLG Modelleren in de Biologie aan, waar nog vijf plaatsen voor beschikbaar…

Dr. Arthur Ram is met ingang van 1 september 2016 benoemd tot Opleidsingsdirecteur van de bacheloropleiding Biologie. Hij volgt daarmee Johan Memelink op.

De resultaten van de voorronde van de Biologie Olympiade Junior 2009 zijn bekend!

Dr. Annemarie H. Meijer van het Instituut Biologie Leiden gaat een nieuw Marie Curie trainingsnetwerk coördineren dat 3,7 miljoen subsidie ontvangt van de Europese Commissie. Het vierjarige project begint in januari 2012 en heet: “FishForPharma: Training Network on Zebrafish Infection Models for Pharmaceutical…

In this thesis, topics relating to the optimization of high-throughput pipelines used for imaging are discussed. In particular, different levels of implementation, i.e., conceptual, software, and hardware, are discussed and the thesis outlines how advances on each level need to be made to make gains…

Een Vici-beurs en ENW-GROOT: wetenschappers van het Instituut Biologie Leiden hebben prestigieuze beurzen van NWO toegekend gekregen. Van onderzoek naar bacteriën zonder celwand tot planten versterken met behulp van micro-organismen.

De Leidse sporters van het jaar zijn weer gekozen. Nicole Beukers (roeien, KSRV Njord), Marie Anne Frenken (roeien, KSRV Njord), Alex Klinkenberg (turnen, Excelsior Leiden), Eelke Roman (waterpolo, LZ 1886) en Monica Wink (taekwondo, Taekwondo Vereniging Leiden) kregen allemaal aanmoedigingsprijzen…

Antibiotic-resistant bacteria pose a major health threat. Addressing this challenge requires among others the development of new antibacterial compounds. The research described in this thesis focuses on discovering novel antibiotics from soil bacteria, specifically Streptomyces and Paenibacillus.Despite…

Promotor: Prof.dr. R.M.H. Merks

Prof. Herman P. Spaink heeft een subsidie gekregen om te screenen voor nieuwe geneesmiddelen tegen tuberculose. Deze subsidie voor de verdere ontwikkeling van robottechnologie voor grootschalige geneesmiddelenscreening was mogelijk dankzij donaties van Leidse alumni.

Kersverse hoogleraar Gerard van Westen werkt op het snijvlak van kunstmatige intelligentie en medicijnontwikkeling. Voor de nieuwe leerstoel Artificial Intelligence and Medicinal Chemistry zet hij computermodellen in om medicijnontwikkeling efficiënter te maken. ‘ Ons ultieme doel is een virtuele mens…

Human language is constantly evolving with its linguistic structure being shaped by language users at both individual and population levels. Focusing on the interplay between processes of language acquisition and communicative need in shaping human languages, this thesis introduces a novel computational…

Iedereen kent het blad National Geographic Magazine. Het blad waarin je op avontuur gaat naar de mooiste plekjes van de wereld.

The Minor Computational Approaches to Disease, Signaling and Drug Targets (CADSDT) is focused on fundamental scientific research required for discovery of new drug targets and development of new drugs.

Valetudo, zo hebben de astronomen het nieuw ontdekte Jupitermaantje genoemd. Het is een weerbarstig exemplaar dat dwars tegen haar soortgenoten in beweegt. In de Volkskrant reageert Leidse astronoom Simon Portegies Zwart op de bijzondere ontdekking.

Volgens de Keuzegids Universiteiten 2014 heeft Leiden vier topopleidingen. Dat zijn Biologie, Sterrenkunde, Griekse en Latijnse taal en cultuur en Biomedische wetenschappen. In de vergelijking tussen de brede, klassieke universiteiten staat Leiden op de tweede plaats.

In this thesis, we have studied cell images from two types of cells, including pollen grains and the immune cells, neutrophils. These images are captured using a bright field microscope and a confocal microscope.

Het kanaal waarmee twee celonderdelen materiaal uitwisselen, blijkt zich aan de rand van hun contactoppervlak te vormen, en niet in het midden. Dat ontdekten de Leidse fysische scheikundigen Jelger Risselada en Edgar Blokhuis samen met onderzoekers van de Universiteit van Lausanne in Zwitserland. Ze…

Professor Paul Hooykaas en Dr. Remko Offringa sleepten namens het IBL de subsidies binnen. Het onderzoek van Hooykaas gaat over het transportsysteem van de bodembacterie Agrobacterium tumefaciens en het onderzoek van Offringa over het proces van somatische embryogenese.

Sonja Boas ontwikkelde nieuwe technieken om het groeiproces van bloedvaten op computationele wijze te bestuderen. De resultaten van haar onderzoek geven een beter begrip van mechanismen in bloedvatgroei en dat is relevant voor de ontwikkeling van medische therapieën. Promotie op dinsdag 22 december…

Lezing

Natural history collections provide invaluable sources for researchers with different disciplinary backgrounds, aspiring to study the geographical distribution of flora and fauna across the globe as well as other evolutionary processes.

This thesis introduces a relational interaction model and a practical tool for describing, visualising and generating interactive dialogues.

Developing new medicines is one of modern science's most significant hurdles, a process marked by high costs, long timelines, and frequent failures of promising candidates.

Promotor: K.J. Batenburg, Co-promotor: A.W. van der Vaart, B. de Smit

This thesis describes the use of a combined approach of computational and experimental techniques to gain novel insights to understand the glycosylation reaction and its reactive intermediates.

Immunotherapies for cancer are an emerging class of therapeutic strategies which aim to treat cancer via augmentation of the immune system.

A common method to solve expensive function evaluation problem is using Bayesian Global Optimization, instead of Evolutionary Algorithms.

Computationeel bioloog dr. Joost Beltman wordt vanaf oktober 2014 aangesteld als assistant professor bij het Leiden Academic Centre for Drug Research (LACDR) van de Universiteit Leiden. Beltman neemt een NWO Vidi-subsidie mee vanuit het Nederlands Kanker Instituut (NKI) die hij in 2013 kreeg om computationeel…

Het Computer Systems, Imagery & Media (CSI) onderzoeksprogramma voert fundamenteel onderzoek uit naar methoden en technieken voor het ontwerp, de implementatie en de applicatie van geavanceerde computersystemen.

De eer was aan Professor Simon Portegies Zwart en doctor Jeroen Bédorf om voor het blad IEEE Software te schrijven.

Wat gebeurt er in ons lichaam als we voor kinderen zorgen? En waarom is de een zorgzamer dan de ander?

In de masteropleiding Linguistics (specialisation) van de Universiteit Leiden kun je kiezen uit acht thema's: Applied Linguistics; Comparative Indo-European Linguistics; Computational Linguistics; Language and Communication; Language Description and Documentation; Language Processing and Cognition;…

We have studied shape with a particular focus on the zebrafish model system. The shape is an essential appearance of the phenotype of a biological specimen and it can be used to read out a current state or response or to study gene expression.

Video games have emerged as one of the most interesting media of the turn of the century. The peculiar characteristic of video games is the biunivocal interaction between the computer and the human player.

Over several decades, a variety of computational methods for drug discovery have been proposed and applied in practice. With the accumulation of data and the development of machine learning methods, computational drug design methods have gradually shifted to a new paradigm, i.e. deep learning methods…